MOFLearning AIIDA+LAMMPS Description

Ce package est une bibliothèque de workflows basés sur AiiDA (via le plugin aiida-lammps) qui réalise des simulations de Dynamique Moléculaire (MD) avec des champs de force classiques afin d’étudier la diffusion d’un gaz dans les matériaux poreux cristallins tels que les réseaux métallo-organiques (MOFs).

Il inclut les workflows suivants, avec différents degrés de reproductibilité :

• utilisation d’un calcul RAW : toutes les étapes sont contenues dans un fichier modèle (template) pour LAMMPS. Cela correspond à une seul noeud dans le graphe de provenance de Aiida.
• utilisation d’un WorkChain : à chaque étape du workflow, un fichier modèle LAMMPS différent est utilisé. Cela donnera lieu à un nœud de calcul par étape (par exemple : étape d’équilibration en Monte Carlo, étape d’équilibration en MD puis étape de production en MD).

Les cas d’exemple possibles sont :

1. MD d’un gaz simple dans un MOF rigide à dilution infinie : des templates spéficiques sont fournies pour les gaz monoatomiques xénon et krypton avec des paramètres de Lennard-Jones issus du champ de force UFF.

2. MD d’un gaz de dioxyde de carbone dans un MOF rigide à dilution infinie. La version actuelle du template incut seulement les interactions à courte portée avec le potentiel de Lennard-Jones.

Diffusion d’un gaz de krypton dans CuBTC.